Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF8P28908 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF8P28908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms