Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLD1P28340 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLD1P28340 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLD1P28340 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLD1P28340 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLD1P28340 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLD1P28340 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLD1P28340 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLD1P28340 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD1P28340 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD1P28340 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms