Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLNP26678 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLNP26678 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLNP26678 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLNP26678 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLNP26678 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms