Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR2AP24928 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2AP24928 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms