Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGS1P23219 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGS1P23219 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGS1P23219 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGS1P23219 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms