Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms