Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME2P22392 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME2P22392 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME2P22392 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME2P22392 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME2P22392 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME2P22392 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME2P22392 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME2P22392 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME2P22392 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME2P22392 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME2P22392 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms