Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD247P20963 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD247P20963 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD247P20963 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD247P20963 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD247P20963 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD247P20963 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD247P20963 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD247P20963 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD247P20963 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD247P20963 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD247P20963 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD247P20963 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms