Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCP20941 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCP20941 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCP20941 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCP20941 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCP20941 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCP20941 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCP20941 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCP20941 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCP20941 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCP20941 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCP20941 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCP20941 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCP20941 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCP20941 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCP20941 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms