Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCN1P20061 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCN1P20061 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCN1P20061 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCN1P20061 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCN1P20061 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCN1P20061 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCN1P20061 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCN1P20061 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCN1P20061 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCN1P20061 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCN1P20061 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 861.1 ms