Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMY2BP19961 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms