Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB3P16520 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB3P16520 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms