Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRF1P14222 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRF1P14222 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRF1P14222 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRF1P14222 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRF1P14222 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRF1P14222 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRF1P14222 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRF1P14222 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms