Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms