Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP2C9P11712 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP2C9P11712 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP2C9P11712 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP2C9P11712 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms