Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESRRAP11474 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms