Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF1P10914 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF1P10914 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF1P10914 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF1P10914 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF1P10914 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF1P10914 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF1P10914 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF1P10914 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF1P10914 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF1P10914 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF1P10914 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF1P10914 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF1P10914 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF1P10914 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF1P10914 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF1P10914 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms