Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETSIPP0DME0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms