Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A2P08572 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A2P08572 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms