Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PFKMP08237 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFKMP08237 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFKMP08237 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFKMP08237 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFKMP08237 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFKMP08237 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFKMP08237 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFKMP08237 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFKMP08237 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFKMP08237 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFKMP08237 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFKMP08237 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFKMP08237 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFKMP08237 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms