Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSF1RP07333 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSF1RP07333 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSF1RP07333 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSF1RP07333 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSF1RP07333 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSF1RP07333 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSF1RP07333 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CSF1RP07333 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF1RP07333 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF1RP07333 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSF1RP07333 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF1RP07333 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.3 ms