Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-5P01602 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms