Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APBB3O95704 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APBB3O95704 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APBB3O95704 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBB3O95704 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APBB3O95704 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBB3O95704 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBB3O95704 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBB3O95704 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms