Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24BO95487 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC24BO95487 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24BO95487 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms