Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX6O95475 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX6O95475 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX6O95475 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX6O95475 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX6O95475 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX6O95475 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX6O95475 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX6O95475 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX6O95475 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms