Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LYPD3O95274 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYPD3O95274 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms