Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE8BO95263 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE8BO95263 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE8BO95263 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE8BO95263 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE8BO95263 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms