Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCELO95171 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCELO95171 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCELO95171 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCELO95171 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCELO95171 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCELO95171 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCELO95171 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCELO95171 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCELO95171 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCELO95171 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCELO95171 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCELO95171 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCELO95171 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCELO95171 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms