Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABLIM3O94929 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABLIM3O94929 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABLIM3O94929 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABLIM3O94929 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms