Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTL6BO94805 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTL6BO94805 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms