Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH16O75309 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH16O75309 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH16O75309 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH16O75309 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH16O75309 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH16O75309 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH16O75309 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH16O75309 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH16O75309 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH16O75309 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH16O75309 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH16O75309 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH16O75309 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms