Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSCO60682 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSCO60682 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSCO60682 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSCO60682 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSCO60682 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MSCO60682 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSCO60682 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSCO60682 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSCO60682 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSCO60682 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSCO60682 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSCO60682 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSCO60682 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSCO60682 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSCO60682 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSCO60682 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSCO60682 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms