Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B3O60423 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B3O60423 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms