Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN3BO60391 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN3BO60391 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN3BO60391 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN3BO60391 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN3BO60391 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN3BO60391 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN3BO60391 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN3BO60391 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms