Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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VEGFDO43915 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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VEGFDO43915 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VEGFDO43915 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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