Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HTATSF1O43719 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1O43719 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms