Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID2O43424 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID2O43424 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID2O43424 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID2O43424 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRID2O43424 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID2O43424 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID2O43424 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID2O43424 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms