Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms