Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTSS1O43312 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms