Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SART1O43290 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SART1O43290 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SART1O43290 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SART1O43290 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SART1O43290 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SART1O43290 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SART1O43290 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SART1O43290 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SART1O43290 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SART1O43290 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SART1O43290 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SART1O43290 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SART1O43290 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SART1O43290 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms