Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms