Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM6AO15550 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM6AO15550 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms