Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NPHP1O15259 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPHP1O15259 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms