Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP290O15078 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
CEP290O15078 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP290O15078 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP290O15078 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP290O15078 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP290O15078 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP290O15078 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP290O15078 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP290O15078 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP290O15078 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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