Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNMO15061 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNMO15061 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYNMO15061 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYNMO15061 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYNMO15061 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYNMO15061 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYNMO15061 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNMO15061 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNMO15061 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNMO15061 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNMO15061 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYNMO15061 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYNMO15061 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYNMO15061 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYNMO15061 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYNMO15061 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYNMO15061 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYNMO15061 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYNMO15061 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SYNMO15061 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYNMO15061 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYNMO15061 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNMO15061 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNMO15061 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNMO15061 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNMO15061 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNMO15061 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNMO15061 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYNMO15061 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYNMO15061 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYNMO15061 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYNMO15061 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYNMO15061 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNMO15061 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms