Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP3O14828 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP3O14828 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms