Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF197O14709 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF197O14709 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms