Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TXNDC9O14530 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms