Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP56O00567 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP56O00567 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP56O00567 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP56O00567 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP56O00567 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP56O00567 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP56O00567 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP56O00567 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP56O00567 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP56O00567 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP56O00567 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP56O00567 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP56O00567 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP56O00567 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP56O00567 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms