Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8VP50 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8VP50 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F8VP50 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F8VP50 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F8VP50 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8VP50 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8VP50 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F8VP50 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8VP50 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms